本发明提供了一种可变焦距的共路型柔性内窥OCT系统及工作方法，第一可调光衰减器用于接收光源的光并传输光至环形器的第一端口，环形器的第二端口用于输出光至柔性内窥镜探头并接收柔性内窥镜探头的反射光，环形器的第三端口用于传输柔性内窥镜探头的反射光至第一耦合器；第一补偿光路用于接收第一耦合器的第一分束光，第二补偿光路用于接收第一耦合器的第二分束光，第一分束光的比例小于第二分束光的比例，第二耦合器用于接收第一补偿光路和第二补偿光路的输出光，光谱仪用于接收第二耦合器传输的光，光谱仪与处理器连接；本发明避免了振动、温度、色散等因素引起的误差补偿问题，降低了系统的复杂度，提升了成像质量。
